Das Weingut liegt an der Costa Brava rund 30 Kilometer südlich von Girona. Nachdem ein französisches Ehepaar 1987 hier mit dem Weinbau begonnen hatte, übernahmen sechs Schweizer Weinfreunde das Anwesen mit der altertümlichen Villa Mas Gil. Als önologischer Berater zeichnete seit Anbeginn Peter Sisseck verantwortlich (Pingus; Hacienda Monasterio). Nach den Plänen des spanischen Architekten Manzanares wurde ein neuer, hochmoderner Weinkeller gebaut. 2020 verabschiedete sich Sisseck zusammen mit zwei weiteren Inhabern von Clos d’Agon. Heute ist Miguel Coronado für die Weine von Clos d’Agon verantwortlich.
Das Herstellungsgebiet der DO Empordà ganz im Nordosten von Katalonien umfasst insgesamt 48 Gemeinden, die sich auf die zwei Landkreise Alt Empordà und Baix Empordà verteilen. Alt Empordà erstreckt sich in einem Bogen vom Kap Creus bis zur so genannten Garrotxa d’Empordà (Albanyà) und grenzt im Norden an die Pyrenäen, im Osten ans Mittelmeer und im Westen an das eigentliche Flachland. Baix Empordà wird im Norden vom Montgrí-Massiv begrenzt, im Südwesten vom Massiv Les Gavarres, das zusammen mit dem Begur-Massiv eine flache Küstenlandschaft bildet, und im Osten vom Mittelmeer. Die Weingärten erstrecken sich von Meereshöhe bis maximal 260 Meter über Meer und die Böden sind äusserst vielfältig: von Sand und Granit über Schiefer und Schwemmböden ist fast alles zu finden. Das klimatische Element mit dem grössten Einfluss auf den Anbau ist der kräftige Nordwind Tramuntana, der mit oft über 120 Stundenkilometer starken Böen über die Landschaft fegt. Prägend sind zudem die milden Winter mit wenig Frost und die heissen Sommer, gemässigt durch die frischen Meeresbrisen.